2010年7月
特別展「空飛ぶカ・ガ・ク 大空への夢」
2010年7月
「空飛ぶカ・ガ・ク」ver.2
2011年5月
特別展「トリックアート展」
2011年7月
特別展「しくみ発見！からくりミュージアム」
2011年7月
特別展「からくりミュージアム」ver.2
2012年７月
特別展「ダイノパーツラボ 恐竜たちのからだのヒミツ」
2012年７月
特別展「ダイノパーツラボ」ver.2
＜かぶりものシリーズ＞
2013年７月
特別展「お化け屋敷の科学 ３Ｄのひみつ」
2014年２月
「ハイサイ！琉球の生きものたち」
2014年6月
特別展「夏のむし・ムシ大集合２」
2015年８月
特別展「万華鏡と光のふしぎ展」
2017年3月
「トリバネアゲハから見える生物多様性 第２回小林平一コレクション展」
2017年4月
特別展「元素ワンダーランド あなたも宇宙も元素でできている」
第113番元素は2016年11月にニホニウムと命名されました。
2017年６月
特別展「夏のむし・ムシ大集合４」
外来生物を紹介
2017年12月「姫路ロボ・チャレンジ冬の陣」
2019年５月
企画展「桜山公園の野鳥」
2019年６月
特別展「夏のむし・ムシ大集合6」
衛生害虫を紹介
